有没有把这些仿真软件都玩过的？

NS 基本上写txt文件代码
opent 图形化搭积木，编状态机
Qualnet/glomosim 类似opnet，模块全C的
omnet 写c++代码，仿真时图形化显示，和c++代码对应关系不错

NS开源，优点是免费自由灵活，直接阅读源代码学习各类协议。总代码量有三十几万行好像，单个协议模块在数千行左右，缺点是学习曲线陡，文档的组织性与完备性比不上商业软件，连最基本的手册的页码都能出错，所以上手困难。玩熟了以后就会接受它的一套方式，灵活性很强。
OPNET 优点是拥有大量接近现实系统的网络模型。缺点在于贵，同样难以学习。它用有限状态机来模拟节点行为，其生成网络拓扑，修改节点属性等操作看似比NS直观易用，其实感觉深入下去还不如NS2方便。
Qualnet是glomosim的商业版，贵，几十万上下。特色在于对大规模网络仿真做了优化，引入了一些新技术，比如物理层支撑定向天线，能够真正做到并行仿真等等。与OPNET类似可以实现交互式图形化的网络建模，协议配置等。里面的协议源码只在代理演示的时候看了几眼，不好评价。评估版则不能阅读修改代码。
NS与OPNET 模拟实际网络的精度问题，有一些专门的文献做过比较，可以去搜一下看看。个人感觉，学校里做论文用NS2，公司企业研究所用OPNET活QUALNET。

这是使用上的区别，要说功能性能上面的优劣，就难了吧

似乎在仿真执行中的代码调试功能上讲，NS最强大，然后是OPNET，qualnet的调试功能最弱

源码级的不都是靠C debugger attach到一个OS process上嘛，都一样。OPNET有自己的调试器ODB，但这个是管它自己的objects，比如process, packet之类，管不了源码。qualnet不知道有没有，但ns2是完全没有的，就靠C debugger。所以我觉得你说反了